ARCHS4: Улучшение анализа наборов данных RNA-seq и CHIP-seq
ARCHS4, разработанный maayanlabapps, является расширением браузера, предназначенным для улучшения анализа наборов данных RNA-seq, доступных на Gene Expression Omnibus (GEO). Это бесплатное расширение добавляет ценный контент на страницы этих наборов данных, предоставляя пользователям дополнительные инструменты и ресурсы.
Одной из ключевых особенностей ARCHS4 является возможность загрузки файлов, содержащих выровненные чтения, сопоставленные с генами с подсчетами. Это позволяет исследователям легко получать доступ к исходным данным и анализировать их, обеспечивая более глубокое исследование и интерпретацию наборов данных. Кроме того, расширение предлагает визуализацию тепловой карты, отражающую сводку данных экспрессии обработанных образцов с использованием Clustergrammer. Это визуальное представление предоставляет пользователям всесторонний обзор паттернов экспрессии генов в наборе данных.
С ARCHS4 исследователи могут удобно получать доступ и анализировать наборы данных RNA-seq, экономя время и усилия при исследовании и интерпретации данных. Это расширение браузера является ценным инструментом для тех, кто работает в области геномики, предоставляя расширенные функциональные возможности и ресурсы для анализа наборов данных.
